Carbohydrate chains occupy truly significant positions in various fields of life sciences and biotechnology. A large number of polyclonal or monoclonal antibodies have been used as very important tools for analyzing expression of carbohydrate chains and their functions. "GlycoEpitope" is an integrated database that consists of useful information on carbohydrate antigens and their antibodies. It has been developed with the cooperation of top class researchers in the field of glycobiology and maintained by the Research Center for Glycobiotechnology in Ritsumeikan University. The GlycoEpitope Database provides a fund of information, e.g. lists of 1) glycoproteins that express carbohydrate antigens (epitopes), 2) glycolipids of which the partial structure is a carbohydrate epitope, 3) enzymes that take part in synthesis and degradation of glycoepitopes, 4) time and site of expression of carbohydrate epitopes, 5) diseases to which carbohydrate epitopes relate, and 6) suppliers where carbohydrate recognition antibodies can be obtained. This database is not limited to glycobiologists, but open to a wide range of life science researchers. Its search criteria are made flexible, so the database is very user-friendly. Here, we would like to introduce a general outline of the database and how it works. A. What is "GlycoEpitope"? GlycoEpitope consists of 5 categories, i.e. general data of epitopes (General), antibodies recognizing these epitopes (Antibody), glycoproteins (Glycoprotein) and glycolipids (Glycolipid) expressing epitopes, enzymes that take a part in synthesis and degradation of epitopes (Enzyme). Additionally, all references are listed under the "Reference" section (Fig. 1). 1) General "General" consists of general information on epitopes: epitope ID specific for this database, name, aliases, sequence of carbohydrate chain structure, history of detection, molecular weight, carbohydrate composition, species in which expression of epitope is recognized, tissue and cell distribution 要 約 糖鎖はライフサイエ ンスとバ イオテクノロジーの様々な 分野において、ま すますその重要性が認められてきている物 質です。そ の糖鎖の発現 と機能解明に最 も有効な手段が、古 くより使われている糖鎖認識ポ リクローン抗体であ り、最 近 のモノクローン抗体です。GlycoEpitopeは、糖 鎖抗原 とそれ を認識する抗体に関する情報 を集約 した総合的なデータベー スであ り、最 先端の糖鎖生物学者 らの協力 を得て構築 され、 立命館大学糖鎖工学研究セ ンターより公開されています。本 データベースは、糖 鎖抗原(糖 鎖エ ピトープ)を 発現する糖 タ ンパ ク質、糖 鎖エ ピ トープを部分構造 とす る糖脂質、エ ピ トープの合成や分解 に関与す る生合成酵素お よび分解酵素、 糖鎖エピ トープの発現の時期・場 所、糖 鎖エ ピ トープの関連 する疾病、糖 鎖認識抗体の入手先 など豊富な情報を取 り揃え ています。ま た、糖 鎖研究者のみならず、糖 鎖に関心 を持つ ラィフサイエンス領域の幅広い研究者 を対象 とし、利 用者が 求めるエ ントリーに容易に到達できるよう、自 由度の高い検 索条件 を提供 しています。こ こでは、本 データベースに格納 されている情報および使い方について紹介 します。 A. "G-yc0Epitope"と は 本 デ ー タベ ー ス は 大 き くわ け て 以 下 の5つ の デ ー タ セ ッ トか ら成 りた って い ます。エ ピ トー プの 一般 デ ー タ(General)、 そ の エ ピ トー プ を認 識 す る抗 体 の デ ー タ(Antibody)、エ ピ トー プ の発 現 して い る糖 タ ンパ ク質 の デ ー タ(Glycoprotein)及 び糖 脂 質 の デ ー タ(Glycolipid)、エ ピ トー プ の 生 合 成・分 解 に関 わ る酵 素 の デ ー タ(Enzyme)で す。ま た、こ れ ら デ ー タセ ッ トに 引用 され た文 献 の 一 覧 を(Reference)に 載 せ て あ り ます(図1)。