Analysis of Genetic Variability of Yersinia pestis Strains (Medieval Biovar) Isolated in Natural Plague Foci of the Russian Federation and Mongolia

49 Штаммы Yersinia pestis основного (высоковирулентного и эпидемически значимого) подвида делятся на три биовара – античный, средневековый и восточный, каждый из которых получил пандемическое распространение во время одной из трех прошедших пандемий чумы. Для каждого из этих биоваров характерна принадлежность к различным ландшафтногеографическим зонам и очагам определенного типа. Штаммы античного биовара распространены, как правило, в высокогорных природных очагах сурочьего типа, в то время как штаммы средневекового биовара – в равнинно-предгорных, степных и пустынных очагах сусликового и песчаночьего типа, а штаммы восточного биовара – в очагах крысиного типа, расположенных на морских и океанических побережьях. В природных очагах чумы в Российской Федерации и сопредельных странах циркулируют штаммы средневекового и античного биоваров, причем большую часть из этих очагов занимают штаммы средневекового биовара, которые распространены на обширных пространствах засушливых зон степей и пустынь. Причины такой широкой распространенности штаммов средневекового биовара остаются не установленными. Возможно, они связаны с изменениями в геноме штаммов средневекового биовара, которые обеспечили их лучшую адаптацию к условиям почвенного биоценоза нор грызунов в засушливых зонах расположения этих очагов. В Российской Федерации существуют 11 природных очагов чумы. Значительное большинство из них (9) составляют очаги сусликового (очаги No 01–03, 14, 15, 38, 37) и песчаночьего (No 16, 43) типов, в которых, как правило, циркулируют штаммы средневекового биовара [6, 7]. Штаммы этого биовара распространены и в большинстве природных очагов чумы, расположенных на пограничных с Россией территориях, в том числе в большой группе Среднеазиатских пустынных очагов (No 18–30, 42), в Закавказских песчаночьих очагах (No 07–13), в очаге сусликового типа в Казахстане (No 17). В связи с этим очевидна необходимость тщательного изучения штаммов Y. pestis средневекового биовара, имеющих широкое распространение на территории Российской Федерации. Важным также является установление генетических особенностей штаммов средневекового биовара из разных природных очагов чумы России и сопредельных стран и определение генотипов этих штаммов, наличие которых необходимо для установления происхождения изолятов Y. pestis и возможных путей заноса инфекции. В основе деления штаммов Y. pestis основного подвида на биовары лежат два дифференциальных УДК 616.981.452:575(471)