Integration eines globalen Traktographieverfahrens in das Medical Imaging Interaction Toolkit

Traktographiealgorithmen liefern potentiell wertvolle Informationen fur die Neurochirurgie sowie fur automatisierte Diagnoseans atze. Dennoch werden sie im klinischen Umfeld bisher kaum oder gar nicht eingesetzt. In diesem Paper prasentieren wir eine open-source Integration des von Reisert et al. vorgestellten globalen Tracking-Algorithmus in das open-source Medical Imaging Interaction Toolkit (MITK) welches von der Abteilung fur Medizinische und Biologische Informatik am Deutschen Krebsforschungszentrum (DKFZ) entwickelt wird. Die Integration dieses Algorithmus in eine standardisierte und offene Entwicklungsumgebung wie MITK erleichtert die Zuganglichkeit von Traktographiealgorithmen fur die Wissenschaftsgemeinschaft und ist ein wichtiger Schritt in Richtung klinischer Anwendungen. Die MITK Diffusion Anwendung, verfugbar auf www.mitk.org, beinhaltet alle Schritte die fur eine erfolgreiche Traktographie notwendig sind: Vorverarbeitung, Rekonstruktion der Bilder, das eigentliche Tracking, live Beobachtung von Zwischenergebnissen, Nachbearbeitung und Visualisierung der Tracking-Ergebnisse. Dieses Paper beschreibt typische Tracking-Ergebnisse und demonstriert die Schritte die zur Vor- und Nachbearbeitung der Bilder und Ergebnisse durchgefuhrt werden.

[1]  Hans-Peter Meinzer,et al.  MITK-DI: A new diffusion imaging component for MITK , 2010 .

[2]  V. Kiselev,et al.  Gibbs tracking: A novel approach for the reconstruction of neuronal pathways , 2008, Magnetic resonance in medicine.

[3]  Susanne Schnell,et al.  Global fiber reconstruction becomes practical , 2011, NeuroImage.

[4]  Marco Nolden,et al.  The Medical Imaging Interaction Toolkit , 2005, Medical Image Anal..

[5]  Christophe Lenglet,et al.  ODF reconstruction in q-ball imaging with solid angle consideration , 2009, 2009 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro.

[6]  R. Deriche,et al.  Regularized, fast, and robust analytical Q‐ball imaging , 2007, Magnetic resonance in medicine.

[7]  D. Tuch Q‐ball imaging , 2004, Magnetic resonance in medicine.

[8]  Maxime Descoteaux,et al.  Quantitative evaluation of 10 tractography algorithms on a realistic diffusion MR phantom , 2011, NeuroImage.