一种电动汽车电机控制器被动整流保护系统，包括电机控制器，电机控制器包括内部设置有高速二极管的IGBT功率模块、IGBT保护电路模块、IGBT驱动模块、DSP控制模块，在IGBT功率模块与驱动电机间的三相电缆中的任意两相上串联设置有电流传感器和电子开关装置，所述的电流传感器将电流信号传递给DSP控制模块，同时，DSP控制模块输出用于控制电子开关装置通断的电平信号。 本发明解决了现有电动汽车电机控制器在整车被动整流状态下电机控制器易被损坏的问题，从而提高电机控制器的使用可靠性。 可广泛应用于电动汽车电机控制器领域。