Alternative splicing: a ubiquitous mechanism for the generation of multiple protein isoforms from single genes.

PERSPECTIVES AND SUMMARy . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . 468 MANIFESTATIONS OF ALTERNATIVE SPLICING . . . . . . . 469 SPLICE SITE SELECTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 470 PATTERNS OF ALTERNATIVE PRE·mRNA SPLICING ........ 476 Combinarorial Exons .. . . . . . . . . . 477 Mutuafly Exclusive Exons . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . ...... . ... . . . . . . . . .. . . 479 Internal Donor and Acceptor Sites . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . 480 Retained Introns. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 483 Alternati ve 5' and 3' -Terminal Exons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 483 READING FRAME CONSTRAINTS ON ALTERNATIVE SPLICING. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 485 MECHANISMS OF ALTERNATIVE SPLICE SITE SELECTION . . . . . . . . . . . ... . . .. . . . . .. 486 Primary and Secondary Structure of RNA Transcripts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . .. 487 Combinatorial Splicing. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . .. . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . 488 Mutually Exclusive Splicing. . . . . . . . . . . . . . . .. . . .... . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 488 Internal Acceptor and Donor Sites and Retained Introns. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 490 EVOLUTIONARY AND BIOLOGICAL IMPLICATIONS OF ALTERNATIVE SPLICING. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . 490