Exploration of a plant architecture database with the AMAPmod software illustrated on an apple tree hybrid family

Ce papier decrit la constitution et l'analyse statistique d'une base de donnees contenant des descriptions d'architectures de plantes a l'aide du systeme AMAPmod. Dans AMAPmod, l'architecture des plantes est representee par un modele formel, nomme MTG, qui constitue la structure de donnees centrale du systeme. Un langage d'interrogation dedie, AML, permet a l'utilisateur d'acceder aux architectures des plantes a l'aide de primitives specialisees et efficaces. En combinant ces primitives, des types de donnees varies permettant de preserver une part plus ou moins grande de l'information structurelle contenue dans la plante peuvent etre extraits de la base de donnees. Des outils specialises ont ete crees pour analyser les echantillons de donnees ainsi constitues. La plupart de ces outils, tant parametriques (modeles markovien varies) que non parametriques (algorithmes de comparaison de donnees fondes sur des techniques de programmation dynamique) s'appliquent a des sequences de donnees. La methodologie AMAPmod est illustree sur une base de donnees architecturale de taille reelle correspondant a une famille d'hybrides de pommiers. (Resume d'auteur)

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[5]  Evelyne Costes,et al.  Modeling the Sylleptic Branching on One-year-old Trunks of Apple Cultivars , 1997 .

[6]  Christophe Godin,et al.  Interactions between light and plant architecture in an agroforestry walnut tree , 1997 .

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[10]  Light Distribution in Discontinuous Canopies: Calculation of Leaf Areas and Canopy Volumes Above Defined ‘Irradiance Contours’ for use in Productivity Modelling , 1981 .

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[13]  H. Honda Description of the form of trees by the parameters of the tree-like body: effects of the branching angle and the branch length on the sample of the tree-like body. , 1971, Journal of theoretical biology.

[14]  P. Prusinkiewicz,et al.  Modeling the architecture of expanding Fraxinus pennsylvanica shoots using L-systems , 1994 .

[15]  Christophe Godin,et al.  Exploring plant topological structure with the AMAPmod software: an outline. , 1997 .

[16]  A STATISTICAL APPROACH FOR ANALYZING SEQUENCES IN FRUIT TREE ARCHITECTURE , 1999 .

[17]  Philippe De Reffye Modèle mathématique aléatoire et simulation de la croissance et de l'architecture du caféier Robusta. III. Etude de la ramification sylleptique des rameaux primaires et de la ramification proleptique des rameaux secondaires , 1982 .

[18]  H. Sinoquet,et al.  Assessment of the three-dimensional architecture of walnut trees using digitising , 1997 .

[19]  Evelyne Costes,et al.  A COMPARISON OF DIFFERENT FRUITING SHOOTS OF PEACH TREE , 1998 .

[20]  K. Kubitzki,et al.  Architecture of Tropical Trees@@@Essai sur l'architecture et la dynamique de croissance des arbres tropicaux , 1972 .

[21]  E. Costes,et al.  3D digitizing based on tree topology: application to study the variability of apple quality within the canopy , 1999 .