Simulating the morphology of barley spike phenotypes using genotype information
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Un modele base sur des L-systemes simulant la morphologie finale de l'epi d'orge (Hordeum vulgare L.), est presente. Les variations naturelles de morphologie de l'epi sont modelisees et reproduites visuellement grâce a l'utilisation de differents jeux de parametres modifiant les regles de croissance et de ramification. La pertinence biologique des phenotypes simules est accrue de diverses facons : (1) les contraintes relatives aux correlations entre parametres sont prises en consideration dans les regles de croissance, (2) les parametres sont choisis en vue d'imiter la morphologie de la plante, (3) l'etendue de la variation des parametres repose sur des observations faites sur les plantes reelles. Le modele vise a predire et visualiser des phenotypes correspondant a des genotypes diploides multigeniques. Ceux-ci sont crees a partir des listes d'alleles appartenant a des locus specifiques (ou QTLs). Les interactions entre alleles (dominance/additivite) ou entre genes (effets epistatiques) sont calculees en utilisant les connaissances fournies par les etudes genetiques experimentales et permettent la prediction des valeurs de variables morphologiques. Deux exemples illustrent les principes du modele: le nombre de rangs d'epillets et la longueur des barbes. L'integration dans le modele des donnees quantitatives sur les effets des QTLs est envisagee.