Automatische Auswertung von Mikro-Array-Bildern
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Wir beschreiben ein Verfahren, das die automatische Segmentierung von Mikroarraybildern in unkalibrierten Umgebungen ermoglicht. Insbesondere behandeln wir die als Adressierung oder in der englischsprachigen Literatur als „Gridding“ bezeichnete Segmentierung der Messpunktgitter. Wir verwenden klassische Regionensegmentierung, Haufigkeitsverteilungen der Abstande zum nachsten Nachbarn, Achsenprojektionen und optimierte Segmentierung durch dynamische Programmierung. Das Verfahren ist fur die automatisierte Segmentierung von Bildserien aus umfangreicheren Experimenten besonders geeignet.
[1] P. Brown,et al. DNA arrays for analysis of gene expression. , 1999, Methods in enzymology.
[2] Franz Kummert,et al. Robust Automatic Microarray Image Analysis , 2002 .
[3] Ash A. Alizadeh,et al. Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling , 2000, Nature.